また、中世では、面白いことに１７世紀のフランスでは「浣腸の時代」と言われていたようです。その背景にあるのは、フランスのパリジャンの世界で１日に３〜4回の浣腸を楽しむのが流行したとのことです。（1日に３〜４回もの糞つまりの処置にために行ったのではなく、安寧のためのようです。）この頃までは、良い器械や医学的な理論が不十分であったため、浣腸程度（腸の一部洗浄）が限界でありました。しかし、１９世紀にロシアの微生物学者　Iiya Iiich Mechnikov　が　腸全体の洗浄について述べました。彼は自家中毒（自らの排泄されない毒素による中毒）の概念を述べ、１９世紀末に目立つようになりました。大腸内の糞便毒素が大腸内側から血液に吸収され、自らの体を毒すると主張しました。アメリカに於いて　Ｄｒ.Ｊｏｈｎ　Ｈｅｒｖｅｙ　Ｋｅｌｌｏｇｅ（ケロッグ　コーンフレークの創設者）がこの理論を支持し、彼のミシガン州バトルクリークにある自然医学クリニックで自家中毒に関して頻繁に講義をしました。彼はＡｍｅｒｉｃａｎ　Ｍｅｄｉｃａｌ　Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ　１９１７年版の記事にて、腸洗浄（食事療法・運動を併用）を行うことで彼の処置した胃腸患者40，000人の内20名を除き手術を回避できたことを報告した。この記事により、アメリカで熱狂的な波が起こり、各種の大腸洗浄装置が医療機関や療養所に設置されました。しかし、当時は現代のように腸内細菌学や腸のメカニズムが充分に解明されていなかった為、自家中毒に関する論拠が乏しかったのです。同時に便秘薬の科学的論拠により徐々に大腸洗浄療法を採用する医療機関が減りました。然しながら、この療法は忘れられたわけではありませんでした。自家中毒の概念・解毒の効果を信じる医学者や自然療法家により継続されていたのです。そして近年、自家中毒の概念と同時に美容の効果も取り上げられて、再び脚光を浴びるようになったのです。特に故ダイアナ妃やアメリカのスパーモデルに親しまれていたのもきっかけになったのでしょう。１９８９年、長い歴史と経てコロンハイドロセラピー国際組合が創立されました。アメリカでは数十万の方に利用されているとのことです。またセラピストも数千人にもなり、解毒・健康維持の目的でコロンハイドロセラピーを行っています。大腸洗浄装置の精度も大きく向上し、製造メーカーもアメリカ・ヨーロッパに複数出来ました。このように機器の発達や腸とその関連分野で研究が行われ、あらためてコロンハイドロセラピーの効果が注目されてきたのです。